Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms