Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms