Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCDC88CQ9P219 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms