Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms