Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms