Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C8orf49Q96NF6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms