Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms