Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF397Q8NF99 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms