Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms