Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID3BQ8IVW6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms