Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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