Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms