Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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CCDC6Q16204 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CCDC6Q16204 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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CCDC6Q16204 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CCDC6Q16204 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
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CCDC6Q16204 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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