Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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