Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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