Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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