Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms