Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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