Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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