Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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NUP160Q12769 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP160Q12769 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms