Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms