Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms