Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG7P83436 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG7P83436 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms