Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LMO4P61968 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms