Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms