Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP8P40818 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP8P40818 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP8P40818 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP8P40818 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms