Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms