Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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