Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SPRR1BP22528 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms