Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms