Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDSP20132 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDSP20132 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDSP20132 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDSP20132 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDSP20132 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDSP20132 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms