Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms