Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms