Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2BP0C7M4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms