Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCAP01258 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCAP01258 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms