Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG7O95352 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG7O95352 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG7O95352 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms