Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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