Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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