Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms