Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDY1Q9Y6F8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms