Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REXO2Q9Y3B8 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms