Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms