Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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