Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms