Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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