Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121845.4-201ENST00000613401 306 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105052.3-201ENST00000639209 1130 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms