Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms