Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms