Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELL2Q99435 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms