Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00526Q96FQ7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00526Q96FQ7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms